在整个组织培养过程中，有三大方面的因素对组培的成功起着极为重要或者说是关键性的影响。即植物材料、培养基和培养环境。这其中以植物材料的影响最根本，其为内因，而另外两种因素为外因。
一、植物材料对组培的影响
1.基因型
植物的基因型主要指种属乃至品种间的差别。如双子叶植物比单子叶植物易于培养，被子植物比裸子植物好培养。既使是同一种内，不同的品种间有时也有很大的差异。在培养过程中，其难易程度往往和自然状态下植株产生不定根、不定芽相关。
2．植株年龄
①植株年龄越大，再生能力约弱。但其胚性组织的再生能力强。
②幼嫩材料比成熟材料易培养。
③即使是成熟材料，特别是茎尖等分生组织，经多次继代培养后，也能恢复到幼嫩状态。
3．组织和器官的年龄
①苗龄小的材料易培养。
②幼嫩、柔软的材料比成熟的、木质化的材料易培养。
③有些植物利用花器官进行培养比较容易。
4.植物的生理状态
①处于无性生长期的材料比有性生长期的材料易培养。
②处于休眠期的材料难培养。
③多年生植物春天取材最好，其次是秋天，夏天取材最差。
④健康植株上的材料比患病植株易于培养。
5．取材年份及生长条件
①气候影响植株的生长状态。如严冬酷暑、旱涝不均等。
②大田、温室条件不同，则取材有别。
③土壤环境不同，也导致植物生长状态不同。
6．取材部位和大小
取材部位：对树木而言，顶端材料不易生根，基部芽易分化，顶芽比腋芽生长快但难以分生侧芽等等。取材大小：材料越小越难培养，含储藏物质多的易培养，切割面大的易培养等。
二、选材注意事项
1．选嫩不选老；
2．选新不选旧；
3．选下不选上；
4．选内不选外；
5．温室好于大田；
6．完整好于损缺。
三、几种材料取用的注意事项
1．茎尖、腋芽：应在开春芽接近萌动时取用，也可把休眠枝取回经过催芽后取膨大的芽苞，剥去外层鳞片后即可使用。
2．花药：一般上午取材。清洗、消毒，在超净台上剥去花瓣，只把花药接在培养基上。
3．种子无菌苗：种子—剥壳—消毒—空白培养基苗—取材（茎尖下胚轴）—培养基。